Dalam memberikan bantuanya, Jepang senantiasa memikirkan bentuk kerjasama seperti apa yang menjadi kebutuhan Indonesia dalam membangun negara serta meningkatkan perkembangan ekonomi dan sosial.

Saat ini , di Indonesia sedang digalakan partisipasi masyarakat di berbagai bidang untuk pembangunan Indonesia, antara lain bidang politik dengan memantapkan sistem demokrasi dalam masyarakat, di bidang sosial dengan membentuk masyarakat yang adil. Di bidang Ekonomi , dengan melaksanakan reformasi di berbagai aspek, Indonesia sedang memasuki tahap pertumbuhan ekonomi yang baru.

Namun dibalik itu , Indonesia juga tengah menghadapi berbagai masalah, antara lain meningkatnya jumlah penganggur dan angka kemiskinan, ketidak stabilan keamanan (konflik) di berbagai wilayah Indonesia seperti Aceh dan wilayah lain , kasus korupsi, perusakan lingkungan dan sebaginya.

Berdasarkan berbagai masalah yang tengah dihadapi Indonesia, Jepang melaksanakan program bantuannya di bidang bidang berikut ini:

• Bantuan untuk pengentasan kemiskinan

Di indonesia masih banyak masyarakat yang hidup di bawah garis kemiskinan. Untuk mengingkatkan pendapat mereka , desa desa pertanian maupun nelayan perlu dikembangkan , dan untuk meningkatakan pendidikan, pelayanan kesehatan dan medis. Semua hal tersebut tercakup dalam bantuan ini.

• Bantuan untuk peningkatan pertumbuhan ekonomi

Sebab utama dari kemiskinan adalah pengangguran. Untuk mengurangi angka pengangguran dan menambah lowongan kerja, diperlukan pertumbuhan ekonomi yang signifikan. Untuk itu, Jepang membantu pembangunan insfratuktur seperti listrik, transportasi, telekomunikasi dan sebagainya. Jepang juga membantu pengembangan sumber daya manusia dan konsolidasi sistem hukum. Diharapkan melalui bantuan ini, angka kemiskinan dapat berkurang dan negara ini akan lebih sejahtera.

• Bantuan untuk pembentukan masyarakat yang adil

Pembentukan masyarakat yang adil adalah sangat pentung agar masyarakat dapat hidup dengan tenang, sehingga dapat menunjukan atau mengeluarkan kemampuan dan bakat yang dimikilinya. Untuk itu, jepang memberi bantuan di bidang reformasi hukum, reformasi kepolisian dan lainnya.

• Bantuan untuk pelestarian lingkungan (konservasi lingkungan)

Sumber daya alam yang melimpah serta lingkungan alam adalah harta kekayaan bagi seluruh rakyat Indonesia. Jepang akan membantu agar seluruh kekayaan alam ini dapat dikelola secara bijaksana sehingga dapat memberi maemberi manfaat bagi rakyat Indonesia.

• Bantuan untuk perdamaian

Perdamaian sangat penting agar seluruh rakyat dapat bekerja sama membangun negaranya tanpa diliputi rasa khawatir akan kehilangan sebuah nyawa yang berharga dalam sebuah konflik. Banutan ini ditujukan bagi pembangunan perdamaian, rekonstruksi (pembangunan kembali) pasca konflik di wilyah wilyah antara lain  Aceh, Papua dan Maluku dan lainnya. Selain itu bantuan inia juga ditujukan bagi pemberantasan terorisme dan pembajakan di laut.